Aamulla hampaat tulisi pestä ennen aamupalaa, jotta aamiaiseen mahdollisesti sisältyvät happamat tuotteet, esimerkiksi tuoremehut, eivät lisäisi harjauksen hankaavaa vaikutusta.
Hammasharjaa pidetään kädessä kevyellä kynäotteella ja harjatessa vältetään liiallista voiman käyttöä. Hampaiden harjaus on hyvä suorittaa tietyssä harjausjärjestyksessä, ensin tulisi harjata ylä- ja alaleuan suun sisäpuoliset pinnat, seuraavaksi purupinnat ja vasta viimeisenä hampaiden huulien puoleiset pinnat.
Harjaus tulisi ulottaa ienrajoille asti, jotta ikenen läheisyydessä oleva plakki saataisiin pois mahdollisimman hyvin. Fluoripitoinen hammastahna tehostaa puhdistamista ja lisää hampaiden vastustuskykyä. Hampaiden harjauksen jälkeen suuta ei saisi enää huuhdella vedellä, jotta hammastahnan fluori pääsisi vaikuttamaan mahdollisimman kauan.
Vääränlaiset harjaustottumukset ja -välineet voivat aiheuttaa harjausvaurioita hampaisiin ja ikeniin. Liian hankaavat hammastahnat yhdistettynä liian kovaan hammasharjaan sekä liialliseen voiman käyttöön hampaiden harjauksessa aiheuttavat hampaiden abraasiota, eli hampaan kovakudoksen menetystä.
Yleensä abraasiokuoppa syntyy hampaan kaulaosaan ja oireilee vihlomalla. Hampaan kovakudoksen menetys lisää myös reikiintymisen todennäköisyyttä. Ronskit otteet hampaita harjatessa voivat aiheuttaa myös ienvetäymiä sekä ienhaavaumia.
